Эритромицин, олеандомицин, нистатин, леворин повышают антибактериальную активность хлорамфеникола, бензилпенициллин — снижает ее. Хлорамфеникол несовместим с цитостатиками, сульфаниламидами, производными пиразолона, фенитоином, барбитуратами. Эритромицин в сочетании с цинком гораздо реже вызывает появление резистентных штаммов, чем эритромицин в чистом виде.
Полипептидные антибиотики могут сочетаться друг с другом. Однако они усиливают ото- и нефротоксичность аминогликозидов (канамицина, стрептомицина, тобрамицина, неомицина, гентамицина).